1- en tesoreria /archivos/parametros de tesoreria tenes una opcion "edita datos para cheques de terceros"
2- tenes facturas cargadas??? que error te da??
3- entiendo que la pregunta es : que emitiste un remito de ventas y lo queres referenciar al facturar
condicion la factura no debe mover stock ( esto se configura desde parametros de ventas o desde un perfil) cuando vas a facturar el sistema te pregunta si tenes un comprobante de referencia y ahi llamas al remito
Por el tipo de consulta me parece que a esa base de datos para quedar totalmente operativa y optimizar el uso, le falta parametrizacion lessugiero que se comuniquen con la administracion y arreglen la contratacion de unas horas de puesta en marcha
saludos