Pedidos pendientes de facturar

Desde el CRM tengo pasados pedidos de servicio a facturar y por X motivo (error, confusión, etc.) no se facturaron tomando el pedido de facturación sino en forma manual o bien parte se factura tomando el pedido y otra parte no. Esto genera que si saco una listado de los pedidos pendientes de facturar me aparezcan cosas que luego de HORAS de análisis consigo descubrir que fue facturado en forma manual o parcial. La consulta es:

            ¿Cómo hago para borrar el pedido de facturación pendiente en el caso que alguna parte de ese pedido ya haya sido facturada?.-

Gracias por las respuestas